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| 文學院 |
中國文學系（含碩士班、戲曲碩士班、碩士在職專班、博士班） |
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| 英美語文學系（碩士班） |
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| 法國語文學系（碩士班） |
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| 哲學研究所（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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一 |
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| 藝術學研究所（碩士班） |
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一 |
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| 歷史研究所（碩士班含碩士在職專班） |
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一 |
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| 學習與教學研究所（碩士班、博士班） |
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一 |
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| 理學院 |
理學院學士班 |
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二 |
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| 物理學系（含碩士班、生物物理碩士班、博士班、生物物理博士班） |
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二 |
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| 數學系（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 化學學系（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 生命科學系（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 統計研究所（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 光電科學與工程學系（含碩士班、照明與顯示科技碩士班、碩士在職專班、博士班） |
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二 |
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| 天文研究所（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 認知神經科學研究所（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 系統生物與生物資訊研究所（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 工學院 |
化學工程與材料工程學系（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 土木工程學系（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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二 |
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| 機械工程學系（含碩士班、光機電工程碩士班、碩士在職專班、光機電工程博士班、博士班） |
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二 |
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| 能源工程研究所（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 環境工程研究所（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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二 |
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| 營建管理研究所（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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二 |
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| 材料科學與工程研究所（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 生物醫學工程研究所（碩士班） |
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二 |
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| 管理學院 |
企業管理學系（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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一 |
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| 資訊管理學系（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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一 |
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| 財務金融學系（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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一 |
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| 會計研究所（碩士班） |
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一 |
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| 經濟學系（碩士班、博士班） |
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一 |
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| 產業經濟研究所（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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一 |
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| 人力資源管理研究所（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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一 |
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| 工業管理研究所（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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一 |
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| 資訊電機學院 |
電機工程學系（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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二 |
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| 資訊工程學系（含碩士班、軟體工程碩士班、碩士在職專班、博士班） |
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二 |
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| 通訊工程學系（碩士班含碩士在職專班、博士班） |
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二 |
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| 網路學習科技研究所（碩士班、博士班） |
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二 |
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| 地球科學學院 |
地球科學學系（含地球物理碩士班、地球物理博士班） |
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三 |
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| 大氣科學學系（含大氣物理碩士班、大氣物理博士班） |
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三 |
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| 太空科學研究所（碩士班、博士班） |
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三 |
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| 應用地質研究所（碩士班、博士班） |
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三 |
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| 水文與海洋科學研究所（碩士班、博士班） |
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|
三 |
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| 客家學院 |
客家社會文化研究所（碩士班） |
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一 |
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| 客家語文研究所（碩士班） |
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一 |
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| 客家政治經濟研究所（碩士班） |
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一 |
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| 法律與政府研究所（碩士班） |
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一 |
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